近10余年来，由于内镜技术和医疗器械迅速发展，经内镜治疗食管胃底静脉曲张出血技术，有了很大提高，安全性及防止再发方面有了明显提高，在国内外引起广泛重视，疗效肯定，可视为首选方法，但治疗时也会有些并发症。
(1)消化系统：常见吞咽困难、食管溃疡、出血、食管狭窄等，而穿孔、食管和气管等严重并发症少见。各种疗法中以无水酒精组并发症最多，术后穿刺部位粘膜糜烂、溃疡可引起出血。硬化、栓塞剂量过大，可并发门脉或肠系膜静脉血栓形成。
(2)呼吸循环系统：硬化剂入血后可并发纵隔炎、纵隔脓肿、胸腔积液、肺不张等并发症。注射剂量过大时，胸腔积液多见，一般为少量渗出液，术后偶可发生心包积液和心包炎。
(3)其他并发症：多种因素可造成菌血症，故术后常规使用抗生素3日；硬化、栓塞术后肾功衰竭发生率很低，有时伴血小板减少，偶见溶血与弥漫性血管内凝血。
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