治疗量的131碘对男女生殖器官影响很小，所以治疗后其生育力不受影响，生育的后代先天畸形、死胎及早产儿的发生率未见增加，不育症的发生率与正常人群无显著差别。尽管一次治疗量的放射损伤不及一次胃肠透视放射损伤大，许多学者还是进行了较为深入的研究。有人观察131碘治疗后的患者，其染色体有变异，但可以逐渐恢复正常。因此，131碘治疗后增加基因突变和染色体畸形的危险性很低。但是，考虑到电离辐射的远期效应、遗传效应，也需要长期随访观察才能得出正确结论。为了保障下一代和隔代子女的健康，将妊娠期列为131碘治疗的禁忌很有必要。
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